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Nossos Serviços

1. DNA ambiental
1.1 Água

Todos os organismos deixam vestígios de DNA na água. Esse ‘DNA ambiental’,
conhecido também como eDNA, pode ser capturado filtrando a água e a partir do nosso
fluxo de trabalho, é possível detectar esses vestígios e confirmar a presença de uma
determinada espécie no ambiente, ou fazer inventários das espécies que o ocupam.
Pesquisando pelo eDNA aquático, você pode rastrear grupos taxonômicos inteiros,
utilizando o método de metabarcoding, onde temos a maior gama de experiência ou
pode detectar a presença de uma única espécie, utilizando o método de qPCR, a PCR
quantitativa.
Nosso serviço de detecção de grupo taxonômicos visa caracterizar a diversidade
de espécies do grupo de peixes, mamíferos, anfíbios, bactérias e macroinvertebrados, a
partir de amostras de eDNA. O eDNA metabarcoding é uma técnica não-invasiva e
economicamente menos oneroso e por isso, de alto custo benefício. Essa análise é
altamente validada e amplamente utilizada, principalmente em países do Hemisfério
Norte e já demonstrou poder complementar os resultados obtidos pelos métodos
tradicionais de monitoramento para avaliação das comunidades de peixes e mamíferos,
por exemplo. O metabarcoding para rastrear as comunidades bacterianas é frequentemente utilizado para detectar mudanças ambientais causadas por práticas de
manejo da terra, atividades de restauração de habitat, práticas de aquicultura e
mudanças climáticas, por exemplo. Além disso, o eDNA metabarcoding de insetos
aquáticos, como grupos bioindicadores, como besouros aquáticos e os grupos EPT
(Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera) é realizado, a fim de superar os desafios
comuns de identificação taxonômica para as espécies desses grupos, além de gerar
dados sobre os índices bióticos.

1.2 Solo e sedimento

Uma amostra de solo ou sedimento conterá centenas de espécies pertencentes a
uma gama diversificada de grupos taxonômicos. Esses pequenos organismos
representam uma grande proporção da biodiversidade global e desempenham um papel
crítico na função e resiliência do ecossistema. Usamos o eDNA metabarcoding para
desbloquear dados poderosos de biodiversidade de solos e sedimentos, ajudando você
a tomar melhores decisões para a natureza e seus negócios. Compreender como as
comunidades de solo e sedimento variam em resposta a impactos e gestão pode
fornecer insights cruciais para orientar a ação em: Avaliação de impacto ecológico,
Acompanhamento do progresso na restauração e biorremediação do habitat, Reduzir os
efeitos da intensificação agrícola na biodiversidade do solo e Melhorar a saúde e a
produtividade do solo.

2. Amostras em massa (bulk samples)

A abordagem de DNA metabarcoding, que propõe a utilização do sequenciamento
de nova geração (NGS), vem ganhando destaque por permitir o acesso em massa à
biodiversidade e transformar a ecologia. O método combina a taxonomia baseada em
DNA barcodes e o sequenciamento de alta performance para identificar vários
organismos simultaneamente. Dessa forma, as análises utilizando metabarcoding são econômicas, de rápida produção, abrangentes, pouco dependentes de perícia
taxonômica e seus bancos de dados permanecem disponíveis para futuras verificações.

2.1 Invertebrados

Ao conservar a biodiversidade nativa, é particularmente importante considerar os
invertebrados, um componente diverso e funcionalmente importante da biodiversidade.
O DNA metabarcoding é aplicável a amostras em massa (“bulk samples” ou “amostras
em bulk”) de invertebrados terrestres e aquáticos. As amostras em bulk consistem em
coleções de invertebrados amostrados usando métodos de amostragem estabelecidos
e conservados de forma apropriada.

2.2 Ictioplâncton (ovos e larvas de peixes)

O estudo do ictioplâncton é fundamental para entender a dinâmica reprodutiva
das comunidades de peixes. Ele se torna ainda mais importante em regiões
megadiversas, como no Brasil, onde há um grande número de instalações de
barramentos para geração de energia. Essas barragens interrompem o fluxo dos rios e
consequentemente, o fluxo dos peixes, principalmente, os migradores que precisam
atravessar grande distâncias para poder desovar e reproduzir. A abordagem de DNA
metabarcoding tem se mostrado eficiente nos estudos ecológicos de ictioplâncton,
permitindo identificar a composição de bulks de ovos e larvas de maneira precisa e
confiável, visto que ovos e larvas de peixes são caracterizados por não apresentarem
caracteres morfológicos que permitem uma identificação precisa por estarem nos
estágios iniciais de vida. Dessa forma, essa técnica pode acelerar e facilitar a taxonomia
de grandes quantidades de organismos.

3. DNA Barcoding

A MetaGen oferece serviços de aplicação de métodos moleculares para a
identificação de espécies e tem mostrado grande potencial em levantamentos e caracterização da fauna, a partir da técnica de DNA barcoding, padronizada em 2003.
Esse método utiliza um fragmento do gene mitocondrial Citocromo Oxidase Subunidade
I (COI), que possibilita a identificação de uma dada espécie, produzindo o seu “barcode”,
assim como um código de barras usado para identificação de um produto qualquer.
Dentre as suas aplicações estão: a resolução de incertezas taxonômicas, certificação de
produtos de origem animal, como por exemplo, os pescados, identificação forense de
produtos de animais silvestres, entre outras aplicações. É uma técnica com alta
resolução, com importante aplicação prática.

4. Avaliação populacional de espécies (Genética de Populações)

Análises genéticas populacionais, assim como, o tamanho populacional, a
distribuição de uma espécie e a estrutura genética entre populações de uma determinada
espécie são parâmetros ecológicos fundamentais. As variações nos parâmetros
populacionais podem nos permitem avaliar quais as possíveis causas, que podem ser
naturais ou não. Nesse contexto, a MetaGen oferece o serviço de avaliação da estrutura
populacional de espécies, utilizando análises de genética de populações, a fim de
mensurar parâmetros ecológicos de espécies e populações.

5. Análises de Bioinformática

Triagem e análises dos resultados de sequenciamento utilizando pipelines e
programas que permitem a interpretação e apresentação mais adequadas dos resultados
de barcoding, metabarcoding e avaliação populacional de espécies.

6. Mentoria científica

Aconselhamento para o desenho e desenvolvimento de projetos, visando auxiliar
na escolha de marcadores, técnicas e análises mais pertinentes para responder as
questões propostas.

7. Treinamento

Oferecemos treinamento teórico e prático em ferramentas baseadas em DNA para
aplicação em biomonitoramento, com anos de experiência em pesquisa. Podemos
aprimorar o conhecimento de suas equipes sobre métodos de DNA e suas aplicações de
forma robusta, a fim de mitigar os desafios específicos de monitoramento da
biodiversidade. O treinamento será adaptado para atender às necessidades de cada
empresa e forneceremos o treinamento utilizando o método a escolha, seja
remotamente, pessoalmente ou de forma híbrida.